Организации с обособленными подразделениями могут сами выбирать, в какой налоговой инспекции им встать на учет.
Если организация имеет несколько обособленных подразделений в одном регионе, на территориях, за которые отвечают разные налоговые инспекции, то организация вправе встать на учет в любой ФНС по своему выбору.
Не имеет значения, по месту головной организации или по месту нахождения обособленного подразделения встала компания на налоговый учет.