При возврате товара, учитываемого с НДС, компания (ИП) должна выставить счет-фактуру продавцу с указанием показателей из ранее полученного счета-фактуры от поставщика на товары, в том числе недвижимое имущество. Такой вывод содержится письме департамента налоговой и таможенной политики Минфина России в от 21 мая 2018 г. № 03-07-09/34040 "О применении НДС при возврате покупателем принятого на учет недвижимого имущества, при реализации которого налоговая база определена продавцом". Счет-фактура выставляется всегда при возврате всей партии товара кроме ситуаций, когда товар возвращается неплательщику НДС. При возврате товара, например, контрагенту на УСН, выставлять счет-фактуру не требуется (письмо Департамента налоговой и таможенно-тарифной политики Минфина России от 10 ноября 2015 г. № 03-07-09/64631 "О применении НДС при возврате товара ненадлежащего качества организацией-покупателем, являющейся налогоплательщиком налога на добавленную стоимость, организации-поставщику, применяющей УСН").
Как отметило ведомство, выставленный счет-фактуру на возврат необходимо зарегистрировать в книге продаж, так как в ней регистрируются счета-фактуры во всех случаях, когда возникает обязанность по исчислению НДС (п. 3 Правил ведения книги продаж, применяемой при расчетах по НДС (далее – Правила).